阴茎癌的病因仍不十分清楚 ，但根据临床观察及统计数字表明，揭示阴茎癌的发病与包茎或包皮过长有密切关系。犹太民族男性新生儿，10天内行包皮环切术，未见有阴茎癌发生的病例。伊斯兰教民4～12岁行包皮环切术，患阴茎癌者极少。而成年后再行包皮环切术，则对阴茎癌无明显的预防作用。因此，阴茎癌可看作是一种包茎或皮过长的晚期并发症，也是一种可预防的肿瘤。阴茎头白斑，增殖性红斑可能癌变，但较少见。经常清洗、保持包皮腔的干净十分重要。
阴茎癌很少浸润尿道海绵体，故一般不影响排尿。阴茎癌恶性程度较低，发生转移较晚，转移途径主要经淋巴，最先出现的转移是沿包皮下层淋巴组织，转移至两侧腹股沟淋巴结，沿血流发生远处转移者，极少见。