北京市垂杨柳医院建于1973年，是北京市东南部地区性医疗中心，规模为二级甲等，床位401张，年门急诊量60余万人次。医院1997年进行临床专业结构调整及人事制度改革，医疗业务取得飞速发展。2003年在朝阳区政府的主持下与同济大学签订合作协议，共同组建大学附属医院性质的同济大学北京微创医院。朝阳区政府已决定扩建医院，建筑面积8500平方米，开放床位550张。
    目前医院已经形成以心血管疾病中心、神经疾病中心、泌尿疾病中心、消化疾病中心等14个临床医疗中心和实验医学中心、影像医学中心、病理医学中心等4个医学技术中心为基本单位的中心化医疗体系。院内开展的冠脉造影术、冠脉内支架植入术、腹腔镜手术、内窥镜技术、眼科小切口白内障超声乳化及晶体植入术、脑血管病的内外科治疗、髋关节置换术等技术项目均达到三级医院水平，泌尿中心开展的尿石症腔内微创治疗、消化疾病中心开展的经皮经肝胆道镜取石术，镜下食管静脉曲张栓塞术在国内享有较高声誉。
    医院内设有同济大学微创医学研究所，各项微创技术在医院均有开展，且在技术项目和规模上呈逐年上升趋势。