非淋菌性尿道炎发病缓慢 ,病程较长 ,比淋病更容易引起合并症 ,一旦合并前列腺炎 ,治疗将很困难。因此 ,非淋菌性尿道炎一定要及早治疗 ,彻底治愈 ,以免发生合并症。非淋菌性尿道炎治疗一定要连续用药 ,不要间断 ,停药不能过早 ,药量一定要充足。所用药物尽量选用对沙眼衣原体和支原体都有效的药物。常用的药物有四环素、二甲胺四环素 ,强力霉素和红霉素。具体方案如下 :
　　无合并症的非淋菌性尿道炎病人的治疗 ,可用下列任一药物口服。

　　(1)四环素 ,口服每日 4次 ,每次 0. 5克 ,用一周后改为每次服用 0. 25克 ,每日 4次 ,再服 2周。

　　(2)二甲胺四环素 (商品名美满霉素 ),口服每日 2次 ,每次 100毫克 ,连续服用3周。

　　(3)强力霉素 ,口服每日 2次 ,每次 100毫克 ,连续服用 3周。

　　(4)红霉素 ,用法与四环素相同。

　　(5)氟哌酸口服 ,每日 2次 ,每次 200毫克 ,连续服用 2周。

　　孕妇和哺乳妇女的非淋菌性尿道炎治疗 :首选红霉素 ,口服每天 4次 ,每次 0. 5克 ,至少服用 7天 ,一般连续服用 3周。禁止用四环素、二甲胺四环素、强力霉素。

　　同时患有淋病的非淋菌性尿道炎的治疗 :先以青霉素或壮观霉素或头孢霉素治疗淋病 ,然后再给予四环素或红霉素治疗非淋菌性尿道炎 ,或者两病采取联合用药治疗。

　　有合并症的非淋菌性尿道炎的治疗 :多采用 2种药物联合治疗 ,如美满霉素与氟哌酸合用 ,疗程至少 4- 6周 ,尤其是并发男性前列腺炎时 ,治疗时间需要更长 ,一般为 3- 6月。治疗过程中要注意的问题 :有的病人症状持续存在 ,或症状消失后又复发 ,或反复发作 ,多半是与有传染性的性伴侣保持性接触有关。因此 ,对所有的非淋菌性尿道炎患者的性伴侣都应进行检查 ,在两者彻底治愈前应避免性接触。